Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc6D3YZP9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc6D3YZP9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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