Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4950D3YUM8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm4950D3YUM8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms