Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms