Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms