Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrr3B2RXA8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms