Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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