Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf1B2RRD7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms