Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc2B2RR83 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc2B2RR83 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms