Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms