Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms