Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cldn34b1B1AZQ8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b1B1AZQ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms