Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CK137956B1AYM9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms