Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssxb8B1AY40 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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