Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms