Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms