Protein–RNA interactions for Protein: B1ART2

Vps13d, Vacuolar protein sorting 13D, mousemouse

Predictions only

Length 4,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13dB1ART2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vps13dB1ART2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms