Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms