Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl41A2AUC9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl41A2AUC9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl41A2AUC9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl41A2AUC9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl41A2AUC9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl41A2AUC9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms