Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms