Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga8A2ARA8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms