Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms