Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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