Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms