Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd1A2AKB4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms