Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc183A2AJB1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc183A2AJB1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms