Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms