Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39aA2ACP1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms