Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8nlA2ABX0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms