Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprfA2A8L5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprfA2A8L5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprfA2A8L5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms