Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkd2l1A2A259 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms