Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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