Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms