Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms