Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SCN11AQ9UI33 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
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