Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TREM1Q9NP99 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TREM1Q9NP99 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
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TREM1Q9NP99 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
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TREM1Q9NP99 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
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TREM1Q9NP99 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
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TREM1Q9NP99 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
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TREM1Q9NP99 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TREM1Q9NP99 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
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