Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEC23AQ15436 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEC23AQ15436 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23AQ15436 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23AQ15436 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEC23AQ15436 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SEC23AQ15436 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.7 ms