Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TNFAIP1Q13829 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.4 ms