Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CACNA1SQ13698 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CACNA1SQ13698 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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