Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLN3Q13286 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CLN3Q13286 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLN3Q13286 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLN3Q13286 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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CLN3Q13286 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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CLN3Q13286 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLN3Q13286 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLN3Q13286 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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