Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TRIM4Q9C037 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRIM4Q9C037 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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TRIM4Q9C037 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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TRIM4Q9C037 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
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TRIM4Q9C037 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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