Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZNF56Q15929 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZNF56Q15929 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZNF56Q15929 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.8 ms