Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDGFRLQ15198 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDGFRLQ15198 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDGFRLQ15198 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms