Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
XRCC4Q13426 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
XRCC4Q13426 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
XRCC4Q13426 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
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