Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SKP2Q13309 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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SKP2Q13309 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SKP2Q13309 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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SKP2Q13309 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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SKP2Q13309 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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SKP2Q13309 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
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SKP2Q13309 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
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