Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DUSP4Q13115 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DUSP4Q13115 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DUSP4Q13115 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DUSP4Q13115 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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