Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPRDP23468 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRDP23468 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
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PTPRDP23468 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRDP23468 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
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