Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
VEGFDO43915 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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VEGFDO43915 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VEGFDO43915 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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