Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SCN8AQ9UQD0 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN8AQ9UQD0 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
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