Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HIF1AQ16665 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HIF1AQ16665 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HIF1AQ16665 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HIF1AQ16665 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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