Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CPSF1Q10570 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-3.24□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-3.24□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
CPSF1Q10570 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CPSF1Q10570 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
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